Istnieje wiele problemów z systemami odwróconej osmozy, niektóre z nich wynikają z inherentnych wad konstrukcyjnych, podczas gdy inne wynikają z odchyleń w eksploatacji i konserwacji podczas codziennego użytkowania, prowadząc do znacznych zagrożeń operacyjnych.
Objawia się to konkretnie w:
1. Podczas początkowej fazy projektowania, wydajność pompy wysokociśnieniowej została dobrana zbyt nisko, co skutkuje niewystarczającą produkcją wody, która nie spełnia wymagań projektowych, gdy zmienia się temperatura lub jakość wody zasilającej;
2. Utlenianie elementów membranowych prowadzi do wzrostu strumienia wody i pogorszenia jakości wody produktowej;
3. Odwrócenie lub uszkodzenie pierścienia uszczelniającego solankę powoduje nadmiernie wysokie rzeczywiste wskaźniki odzysku, prowadząc do osadzania się kamienia i pogorszenia jakości wody;
4. Uszkodzenie O-ringu prowadzi do pogorszenia jakości wody;
5. Mieszane użycie starych i nowych elementów membranowych lub różnych typów elementów membranowych prowadzi do pogorszenia wydajności systemu;
6. Nakładanie się lub częściowe nakładanie się pierścienia oporowego zbiornika ciśnieniowego i wylotu wody skoncentrowanej powoduje osadzanie się kamienia z powodu nadmiernie wysokich wskaźników odzysku;
7. Nadmierna długość zbiornika ciśnieniowego powoduje wyciek solanki do strony wody produktowej, co skutkuje pogorszeniem jakości wody produktowej;
8. Brak manometru sprawia, że analiza i ocena stanu pracy odwróconej osmozy są niewiarygodne;
9. Większa różnica ciśnień powoduje, że element membranowy ulega efektom teleskopowym i ulega uszkodzeniu;
10. Wzrost ciśnienia zwrotnego produkcji prowadzi do zmniejszenia natężenia przepływu produkcji;
11. Nieracjonalne rozmieszczenie odwróconej osmozy powoduje lokalne zwiększenie strumienia wody elementów membranowych i przyspiesza tempo zanieczyszczenia;
12. Projekt wskaźnika odzysku odwróconej osmozy jest nieuzasadniony, z niewystarczającą liczbą elementów membranowych;
13. Zanieczyszczenie cząstkami stałymi powoduje znaczne mechaniczne zanieczyszczenie elementów membranowych, prowadząc do zwiększenia różnicy ciśnień w pierwszym etapie, zmniejszenia produkcji wody i pogorszenia jakości wody;
14. Osadzanie się zanieczyszczeń i zanieczyszczenie bakteryjne/mikrobiologiczne spowodowane wyłączeniem systemu.